Het gevechtssysteem is volledig herzien, met inspiratie uit Assassin's Creed Shadows. Spelers kunnen zwaarden, verborgen messen en vuurwapens gebruiken met verbeterde vloeiendheid, inclusief omgeving-eliminaties en de mogelijkheid om vijanden als menselijk schild te gebruiken. Ubisoft heeft ook diëgetische aanwijzingen tijdens gevechten toegevoegd via animaties — bijvoorbeeld, de hoed of hoofdbedekking van een vijand valt af wanneer zijn verdediging is gebroken.
Belangrijk om te weten: het Verborgen Mes is nu uitsluitend voor stealth-situaties. Het Verborgen Mes werkt strikt binnen stealth-contexten — alleen contextuele kills en stealth-eliminaties. Directe gevechtstoepassingen zijn volledig verwijderd. Edward vecht met zwaarden wanneer gevechten openlijk plaatsvinden.