Het gevechtssysteem is volledig herzien, geïnspireerd door Assassin's Creed Shadows. Spelers kunnen zwaarden, verborgen messen en vuurwapens hanteren met verbeterde vloeiendheid, inclusief omgevingskills en de mogelijkheid om vijanden als menselijk schild te gebruiken. Ubisoft heeft ook diëgetische aanwijzingen tijdens gevechten geïntegreerd via animatie — bijvoorbeeld, de hoed of hoofdbedekking van een vijand valt af wanneer hun verdediging is gebroken.
Opmerkelijk is dat het Verborgen Mes nu alleen in stealth-context werkt. Het Verborgen Mes werkt strikt binnen stealth-situaties — alleen contextuele kills en stealth-kills. Directe gevechtstoepassingen zijn volledig verwijderd. Edward vecht met zwaarden wanneer gevechten openlijk plaatsvinden.